A AEA/SE foi fundada em 08 de fevereiro de 1988. Sua Ata de fundação foi subscrita por 05 sócios, empregados aposentados da Caixa Econômica Federal, Filial de Sergipe.

Seu estatuto foi aprovado em reunião do dia 20 de outubro de 1988, sendo alterado pela primeira vez em fevereiro de 2017.

Inicialmente a AEA/SE funcionou em sala cedida pela Gerência Geral da Caixa Econômica Federal/Filial de Sergipe na rua João Pessoa 357, no 3º andar. Atualmente sua sede social está localizada na sala 204 da Galeria Norcon, na rua João Pessoa 71/75, em Aracaju/SE, adquirida na gestão de Raimundo Santos Andrade.